Systém observačního výzkumu zaměřeného na kvantifikaci mohutnosti a dynamiky uhlíkového deponia v ekosystémech ČR. Identifikace účinků faktorů prostředí, včetně předpokládaných důsledků GZK, na schopnost ekosystémů vázat uhlík. Identifikace uhlíkových sinků a jejich vazby na parametry prostředí (výsledky impaktových studií ekofyziologických analýz). Výstupy slouží také pro kalibraci leteckých snímku s ohledem na identifikaci deponií uhlíku metodami zpracování obrazu hyperspektálních snímků.

Ekosystémová stanice (ES) je zařízení umožňující komplexní monitoring a kvantifikaci toků energie a látek daným ekosystémem. Je tvořena měřící věží (MV), nesoucí systém sledování porostního mikroklimatu (měření složek sluneční radiace – dopadající, odražená a prostupující, globální a fotosynteticky aktivní radiace, radiační bilance, výškový gradient teploty arelativní vlhkosti vzduchu, rychlosti proudění vzduchu a koncentrace CO₂). MV dále slouží jako nosič systému pro měření toků uhlíku, vodní páry a latentního a zjevného tepla do porostu – eddy-kovariační technika. Eddy-kovariační systém tvoří 3D sonický anemometr (rychlé měření turbulentního proudění vzduchu a infračervený analyzátor CO₂/H₂O – měření změn v koncentracích těchto plynů) s výpočetní jednotkou (výpočty a archivace dat). Výsledkem je „on-line“ stanovení hodnot okamžité produkce ekosystému. MV umožňuje přístup do korunového patra porostu pro účely expeditivních ekofyziologických šetření. Součástí ES je automatický systém respiračních komor umožňující sezónní měření výdej CO₂ z půdy a povrchů kmene. ES tvořící infrastrukturu CzeCOS  reprezentují následné typy ekosystémů v ČR :

1. středněvěký horský smrkový les, Bílý Kříž, Moravskoslezské Beskydy, 875 m n.m.

2. dospělý bukový les, Štítná nad Vláří, Bílé Karpaty, 540 m n.m.

3. agrosystém,  Křešín u Pacova, Českomoravská vrchovina, 545 m n.m.

4. dospělý smrkový les, středních poloh, Rájec-Jestřebí, Drahanská vrchovina, 625 m n. m.

5. lužní les, Lanžhot, údolní niva Moravy a Dyje, 155 m n.m.)

6. louka, Lanžhot, údolní niva Moravy a Dyje, 155 m n.m.)

7. mokřad Mokré louky, Třeboň, 425 m n.m.

8. topolová plantáž, Domanínek, Českomoravská vrchovina, 575 m n.m.)

Popis měření atmosférické stanice Křešín u Pacova